Os rios da Estônia são muito pequenos e entre os setecentos rios do país, apenas nove podem se orgulhar de ter superado a marca dos cem quilômetros.
Rio Piusa
Piusa passa pelos territórios de dois estados - a República da Estônia e a Rússia. O comprimento total do leito do rio é de noventa e três quilômetros. A divisão é a seguinte: a Estônia possui oitenta quilômetros de Piusa; a parte do território russo representou um pequeno treze quilômetros. A área de captação total é de 796 quilômetros quadrados.
A nascente do rio está localizada nas terras da Estônia nas águas do Lago Alasjärv (a aldeia de Villa, localizada na direção sudoeste da aldeia de Vastseliina - doze quilômetros). A foz do rio é um espelho do Lago Peipsi, não muito longe da aldeia de Budovizh. Na confluência, o Piusu se divide, desaguando no lago em dois braços.
O curso médio do rio - dezoito quilômetros entre as aldeias de Vastseliina e Saetamme - corre ao longo de uma bela depressão. Foi ela quem se tornou o local onde a reserva foi organizada. Foi fundado em 1965 e cobre uma área com uma área total de mais de nove quilômetros quadrados.
Rio Võhandu
Võhandu é a via navegável mais longa da república. Seu comprimento total é igual a cento e sessenta e dois quilômetros. A fonte de Võhandu está localizada perto do assentamento estoniano de Saverna. Depois disso, ele transita pelas profundezas do Lago Jiksi e completa a jornada, conectando-se às águas do Lago Quente. Isso acontece não muito longe da aldeia de Võõpsu.
Vale ressaltar que antes do Lago Vagula, os moradores chamam este rio de Pyhajõgi, mas após sua saída de suas águas - Voo.
As embarcações navegam ao longo do rio ao longo do trecho delimitado pelo Lago Peipsi e do porto localizado no território da aldeia de Võõpsu. Vários riachos são os principais fornecedores de água para Võhandu.
Rio Parnu
Pärnu é um rio da Estônia com um comprimento total de cento e quarenta e quatro quilômetros. A área total de captação é de quase sete quilômetros quadrados. A nascente do rio é um lago em miniatura com origem em nascente (não muito longe de Roosno-Alliku), mas termina a rota de Pärnu, desaguando nas águas da Baía de Pärnus (parte do Golfo de Riga, área de águas do Báltico).
O rio é alimentado de forma mista. E se nos trechos superiores as águas subterrâneas se tornam fornecedoras, nos trechos inferiores são as chuvas. O rio nem sempre congela no inverno. Se isso acontecer, o gelo se forma a partir da segunda década de dezembro e dura até o final de março.
O rio é navegável apenas próximo ao local de sua confluência. O leito do rio está bloqueado por barragens em onze lugares.
